天文方面，是地圆学说，甚至还提出了金星、水星绕太阳运行的正确猜测。
物理学方面，他提出了被后世称之为“气光波动说”的朴素光波动学说，并在此基础上阐释了他的“光肥影瘦”主张等等。
医药学方面，主要是中西医结合的论述，让中医取长补短。
另外，他的书中还介绍了属于生活科学方面的知识，如其中的“洗面筋法”、“去衣垢腻法”、“藏书辟蠹法”等，这些条目为该书增添了不少“居家必备”的实用价值。
但不管他怎么样，对于黄宗羲问出的这些问题，那是真得被震惊了：这看不见、摸不着的空气，竟然是和水类似，真得太让人惊讶了！
不得不说，方以智对于科学一途，有着比别人都没有的兴趣。因此，听完之后，他当即大喜，站了起来，大步走到黄宗羲面前，感慨地说道：“太冲兄这那是来请教问题的，而是来传道受业解惑也！今日一席话，真是朝闻道，夕死可矣！”
此时的方以智，就感觉又打开了一扇认知的大门，这让他有种欣喜若狂的感觉。
不过黄宗羲听了，却是没有一点自豪之意，依旧是那副愁眉苦脸的表情，对方以智说道：“密之误会了，我今日真得是来请教的。你看我这样子，我是实在没折了？”
“啊……”方以智一听，不由得惊讶。看看黄宗羲，真得不像说假话，便立刻好奇地问道：“那太冲兄是想出了什么难题，又自己解不出来的？”
“唉，不是我自己想出来的！”黄宗羲听了，叹了口气说道，“我本欲得到恩师首肯，便去拜师学道，结果却先给了这么一个难题。要是解答不出来的话，一切就休提了！”
“哦？”方以智听了，不由得更是感兴趣，连忙追问道，“什么难题，说来听听？”
说这话的时候，他是已经没有之前的底气，这语气都是弱了几分的。
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